肛瘻掛線一般7-10天即會脫落，如果掛線內切割的組織比較少，脫落時間就相對比較短，短的在一週之內就會脫落。而如果瘻管位置非常高，甚至是位於直腸的內口進行掛線治療時，由於其掛線內結紮的組織比較多，所以其脫落時間相對會延長，有可能要7-10天甚至10天以上。

期間如果掛線鬆弛，需要及時進行緊線以促進掛線的脫落，掛線脫落以後切口完全癒合，肛瘻的治療才算結束。所以肛瘻掛線術後患者需要定時回醫院複診，檢查掛線，平時自己在排便後清洗時也可以自行牽拉掛線，促進其脫落。