子宮內膜異位症的治療，應根據患者的年齡、症狀、病變部位和範圍，以及對生育的要求等情況加以全面考慮。

第一、病變輕微、無症狀或症狀輕微者，一般可數月隨訪一次。經期有輕微疼痛史，給予前列腺素抑制劑對症治療。

第二、希望生育的患者，應當進行不孕的各項檢查。

第三、輕度患者先行藥物治療。

第四、有生育要求的重度患者，行保留生育功能手術。

第五、無生育要求的年輕重症患者，採用保留卵巢功能的手術，手術後用性激素鞏固治療。

第六、無生育要求的年長重度患者，考慮根治性手術。