子宮內膜異位症的治療分為藥物和手術兩種方法，需要進行手術治療的患者如下：

1、如果症狀、體徵都提示有子宮內膜異位症的病灶，同時臨床表現為繼發性痛經進行性的加重，或者性交的深部疼痛，陰道後穹窿有觸動性的結節；

2、B超或者磁共振的檢查發現有明確的子宮異位病灶，且範圍比較大的情況下；

3、當陰道B超提示卵巢巧克力囊腫的直徑過大，超過4公分以上；

4、不能夠排除巧克力囊腫惡變可能，或者是多發囊腫；

5、如果合併不孕症的患者，或者藥物治療不理想，且症狀比較明顯的患者；

6、當輸卵管有梗阻或者腸管狹窄，考慮是異位病灶引起的患者。