肛瘻手術的相關併發症有以下情況：

1、最常見肛門功能會受到嚴重影響，只要做肛瘻手術，大多數患者肛門功能或多或少有影響；但多數患者影響比較輕微，對控便功能影響不是很明顯，不會造成失禁；

2、肛瘻做完手術以後肛門狹窄，但幾率較低；因為肛瘻手術會把肛門肌肉切開一部分，所以患者做完手術後一般不會引起嚴重狹窄情況；

3、肛門形態會出現變化，尤其是較深的複雜肛瘻，甚至要把肛門打開，患者會發現肛門有形態變化，出現鑰匙孔樣畸形，即肛後面有小窟窿樣東西，也相對比較常見；

4、部分患者會出現肛門總是黏糊，即肛門溢液的情況；肛門切完以後也要長瘢痕，瘢痕組織彈性相對於皮膚相對下降，形成肛門小槽，肛門黏液會通過肛管內槽流到肛門外面，此情況相對比較常見。

綜上所述，肛瘻手術以後併發症最常見肛門功能影響、肛門狹窄、肛門溢液及肛門形態變化四個狀態。