吃大蒜不能治療肛瘻，大蒜素有抗炎、抗感染的效果，但是吃完大蒜以後在消化道內經過消化和各種酶分解以後，大蒜素到肛門附近時候的量已經非常少，幾乎無法起到抗菌的作用。

同時肛瘻是一個潛行的竇道，竇道內如果引流不通暢，又存在內口感染原，在上述情況下單純進行抗感染、抗炎治療無效。最終一定是通過手術去除感染原、清除竇道才能達到治療的效果。所以，大蒜對於肛瘻的治療沒有幫助。