子宮內膜異位症較難治療，可能會長期存在，要儘早發現儘早治療，否則可能會長時間甚至終生不能夠完全治癒。造成子宮內膜異位症的原因通常是由各種原因造成子宮內膜脫離正常環境，進入輸卵管、卵巢、盆腔、陰道或者剖腹產的瘢痕等部位，離開本該存在的地方就叫子宮內膜異位症。子宮內膜會隨激素的變化而增長，只要存在月經來潮，子宮內膜就會再次生長，所以子宮內膜異位症在未閉經前通常會持續存在，導致難以治療。

懷孕或哺乳時，子宮內膜異位的病灶會萎縮和縮小，可能對病情的發展產生抑制。可使用藥物治療，但會導致年輕的女性提前絕經，所藥物治療通常較短暫，療效也屬於短期，能夠長期治癒的機會較少。