子宮內膜異位症是指子宮內膜組織，包括腺體和間質，生長在子宮體腔以外的部位。子宮內膜異位症的病因到目前還沒有具體的明確，但是也有幾種主要發病機制的學說。首先是經血逆流學說，也就是每次來月經的時候，月經的經血通過輸卵管逆流到盆腔內。經血逆流學說可以解釋盆腔發生的子宮內膜異位症，但是不能解釋發生在肺部、胃腸道、甚至是腦部、鼻腔的子宮內膜異位症，所以又相繼出現體腔上皮化生學說和在位內膜決定論。

而且現在發現，在家族中如果母親患有子宮內膜異位症，女兒發生子宮內膜異位症的風險也會相應增高。子宮內膜異位症還具有種族的遺傳傾向，所以子宮內膜異位症也可能是遺傳疾病，由基因和環境共同作用造成。