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肝囊腫可以微創手術，肝囊腫是肝膽外科比較單純的疾病，手術操作相對比較簡單，主要是把囊腫暴露在肝外的一面去掉。所以手術操作比較簡單，現在都知道做微創、腹腔鏡，在腹部打幾個洞，一般1cm差不多，小的基本上有0.5cm就可以，打2-3個洞，然後伸進去器械比如超聲刀。我們應該見過剪刀，一些能量器械，把被蓋切掉。為了預防復發或者又包裹起來形成囊腫，主要是大網膜，把它遊離足夠長，塞在嵌成的囊腔裡，使它粘連在那，使產生的新水分能夠吸收掉，避免復發。這種微創手術很快就可以出院，是比膽囊切除甚至還要快的手術方式。
囊腫最常見為肝囊腫、腎囊腫、皮脂腺囊腫或腱鞘囊腫。肝囊腫是肝臟比較常見的良性疾病，囊腫大多數情況下為良性疾病。如果胰腺上有小囊腫需要注意，其是否有惡性的可能性。常規肝囊腫、腎囊腫一般均為良性，而且多數病人為先天性肝囊腫合併腎囊腫，並且多發。肝囊腫如果較小，直徑3-5cm，一般不需處理，如果較大，直 徑10cm左右，建議去醫院就診，看是否有必要手術治療。如果腎囊腫較多且較大，會影響到腎臟功能，因為腎臟代償能力跟肝臟相比稍微差一些。如果腎囊腫直徑在3cm左右，也需前往醫院就診。在骨科範圍，腱鞘囊腫一般和外傷相關，比如最常見為手腕部、關節處囊腫，此類腫物進行小的骨科手術即可處理。皮脂腺囊腫即粉瘤或粉刺，此類囊腫多長在體表，如果處理，做小手術切除即可。
多發性肝囊腫指的是大於兩個的囊腫，即肝臟的囊腫數量較多，簡稱多囊肝。囊腫預後較好，至於發生的機理，多數是先天性，都是在胚胎髮育時期，管道異常，如應當正常形成膽管的細胞，幾個細胞進行組合之後，形成閉合的環狀、球狀，產生囊，而這個囊中包含液體，就稱囊腫。肝囊腫的預後較好，建議定期做檢查，如果囊腫直徑大於5cm，需要處理。如果小於5cm，定期做檢查就可以。另外，臨床上多囊肝的患者長期的預後不太好，有些患者會發生肝硬化和肝硬化腹水，所以定期做檢查非常關鍵。對於囊腫的處理，主要是手術處理，囊液的抽吸或者囊腫的剝離都是臨床上常採用的術式。
肝囊腫的常規術式是囊液抽吸術，普通內科的大夫都可以做，需在B超定位下找囊腫，插入一根針，將囊液抽吸掉，抽淨液體之後，注射膠類東西或者是無水酒精，使囊液黏合，這種手術費用比較低下。多囊肝建議開腹，也稱為開窗治療，可以做整個囊腫的剝離。但是多囊 肝，大於5cm的囊腫要處理，如果單純的囊液抽吸術，可能需要3000-4000元。但是多囊肝的手術，要根據囊腫的數目、伴隨症狀嚴重程度，可能需要上萬元的費用。
膽囊疼和肝疼很難鑑別，肝和膽是密切相關的臟器，膽囊在肝的底部，右側上腹即斜部，即俗稱的兩肋插刀的肋骨部，有可能是肝疼痛，也有可能是膽囊的疼痛，要結合病史確定。如果既往有膽囊炎病史，B超曾經顯示膽囊有水腫，有雙邊徵或者進食之後病情加重，很可能是膽囊的誘發疼痛。膽囊的疼痛,觸碰疼痛的部位會加重。肝病的肝痛，大多數是隱隱約約的疼痛，觸碰可能不會有疼痛加重表現。肝痛和膽痛很難區分，肝和膽一體，臨床上可以根據腹部B超進行鑑別。在治療方面，西藥可能沒有特別好的效果，可以用中藥治療，進行疏肝利膽。
肝囊腫早期、小的時候症狀不明顯，往往都在體檢或做B超時發現。隨著肝囊腫的增大，出現壓迫症狀，比如出現膽道的壓迫，出現黃疸。進一步發展體積增大，會出現上腹部飽脹、食慾不振或者影響食慾的症狀，再進一步發展會壓迫膈肌影響呼吸。如果肝囊腫突然增大，有可能是炎症、破裂或者出血，這時肝囊腫的症狀就會出 現發燒、腹痛症狀，需要儘快到醫院就診。隨著囊腫增大，會出現上腹部的特別是右上腹的憋脹、壓迫胃腸道，出現食慾不振或者消化不良。如果壓迫膈肌，就會影響呼吸，導致呼吸困難。如果進一步壓迫，會壓迫胸腔，影響心臟功能。一般肝囊腫不會出現這麼嚴重的症狀，如果肝囊腫突然腫大，或者突然增大，有可能是囊腫內出血、炎症感染，或者引起外傷破裂，就會引起上腹部疼痛、劇烈疼痛或者疼痛範圍逐漸增大，伴有發燒的急腹症症狀。這時需要儘快到醫院就診，以免耽誤病情。
輕微肝囊腫這種說法不太準確，應該是小的肝囊腫需要治療嗎。肝囊腫的治療，應根據它的位置、大小和症狀來決定治療與否。一般小肝囊腫沒有壓迫症狀，不需要治療，定期複查就可以，一般不會發展到肝癌這種程度。肝囊腫如果增大到一定程度，增大到5cm以上，一般會出現壓迫症狀，會影響肝功能，出現囊腫扭轉或者囊腫內出血或者囊腫破裂，這時需要外科手術治療。手術治療一般是平常說的開窗術、開天窗，把黏膜層的囊腫切開，如果囊液是清亮的、沒有膽汁，把它引流以後，囊腫產生的囊液就可在腹腔裡吸收。這種情況是常見體表表淺的囊腫手術的常見術式，如果是多發性囊腫，根據位置大小，可做囊腫整體切除術，也可做肝葉切除術，這要根據具體的情況來確定。