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纖維支氣管鏡主要是針對氣道的疾病，包括氣管、支氣管、段支氣管以及細支氣管的病變，也包括支氣管內的病變、支氣管外的病變。部分患者可以做活檢，還可以取痰標本，進行支氣管肺泡灌洗。肺穿刺是在CT引導下經皮到達病變的肺組織，給予穿刺活檢。上述兩種操作分別針對氣道的病變和肺實質的病變，可以互相補充彼此的不足。肺穿刺主要針對外周性的肺部病變，包括腫瘤和部分小結節，還有瀰漫性肺部疾病，肺穿刺主要是對上述病變進行診斷。
纖支鏡可以檢查的疾病包括支氣管肺癌，也稱為中央型肺癌，包括氣管的腫瘤、支氣管的腫瘤、支氣管內膜結核、支氣管的異物，還有不明原因引起的咳嗽、咯血、下呼吸道感染，下呼吸道感染患者取痰標本有利於提取肺部感染的細菌學證據。
纖支鏡檢查後通常3-4個小時可以進食、進水，如果纖支鏡檢查後患者感到口乾，可以給予水、飲料溼潤嘴唇。部分患者會出現咳嗽或痰中帶血，是取活檢造成，患者不用擔心，可自行緩解、停止。如果出現大咯血，可以告知醫生，讓醫生給予相應的處理。可以在檢查後3-4個小時進食，無特殊要求，之前如何進食，現在照舊即可。部分患者感覺咽喉部不適，此種情況可以自行消失。如果告知醫生，可以給予潤喉的含片或者霧化吸入處理，從而改善症狀。
肺部腫瘤患者的生存期，主要取決於其分期及個體差異，具體如下：1、如果是早期的肺癌，原位癌或者微浸潤癌，尤其是目前比較常見的肺結節、肺磨玻璃結節，也屬於肺癌，此類患者通常手術之後就可以達到徹底治癒；2、浸潤性癌患者的生存期與其分期、個體差異有關，如果是ⅠA期肺癌患者，則其五年生存率能夠達到85%-90%，但是如果是Ⅳ期肺癌，五年的存活率僅約為10%。
如果是明確診斷的肺錯構瘤，1cm可以不用做手術，長期觀察即可，因為錯構瘤是良性腫瘤。但是對於判斷不了的腫瘤，只能在手術中取出來進行診斷。這種情況都得做手術，有些比較大的腫瘤，手術非常容易，不用修復外周組織，把肺切開，取出肺錯構瘤，然後把肺做相應的修補即可。但是1cm以 下的腫瘤，如果確診是錯構瘤，可以不用做手術，因為其畢竟是個良性腫瘤。
肺錯構瘤手術後，若術前病人肺的質量較差，合併有慢性氣管炎，或者肺部有炎症，術前沒有覺察出來、沒控制、沒做相應的處理，術後可能出現肺部感染。病人手術後造成疼痛，不敢咳嗽、咳痰，且忽視術後肺的護理，可出現繼發性的肺部感染或肺不張。此外，部分病人有糖尿病 的因素存在或者營養狀態情況不好，也可能出現術後傷口感染。因此在術前儘量控制好病人的血糖，改善其營養狀況，手術一般是不會出現感染的。
肺錯構瘤因為是周圍性的肺良性腫物，手術難度不大，手術切除時間很短，手術操作很容易，只要患者沒有基礎病，基本上都能很快恢復。這種病人一般都是做單孔胸腔鏡手術，只要術後2-3天，胸腔沒有積液就可以拔除胸腔引流管。如果複查CT沒有異常，就可以讓病人出院，到門診隨訪。術後2周讓其來門診複查，如果沒異常情況，以後年度正常複查即可。
肺錯構瘤手術後的護理沒有特別之處，因為其是肺部的良性腫瘤切除，通過外科快速康復技術，病人完全不用氣管插管，用全麻喉罩就能可以做手術。病人術後當天就可以下床活動。錯構瘤術後通常會放很細的胸腔引流管，如果胸液不多，術後第2-3天就可以完全拔除胸腔引流管，術後第3天就可以出院。對於心肺功能差的病人，一定要小心，不能因為手術小，就忽略了危險因素。如心肺功能差的老年人或伴有慢性氣管炎的病人，一定要敦促其術後好好地拍背咳痰，儘早下床活動。
肺錯構瘤是良性腫瘤，手術做完後，一般病人出院後2周來複查，做胸片或者CT，看胸腔有沒有積液。患者做了肺手術，還需明確有沒有存在肺不張、肺部感染的因素。醫生還要詢問病人有沒有發燒、有沒有胸水，2周後拍了胸片或者CT後，如果證實沒有問題，可以建議病人年度來複查 。每年像正常健康體檢一樣，做胸部的低劑量螺旋CT，或者拍個胸片，看看有沒有特別的情況。雖然肺錯構瘤是良性腫瘤，如果沒有年度複查，就不能保證以後肺有沒有長腫瘤的可能性。
肺血管畸形包括肺動靜脈畸形、支氣管肺隔離症、肺動脈瘤等，臨床上常見是肺動靜脈畸形，80%是先天性主要是肺毛細血管發育異常，胚胎髮育過程中，胚芽周圍靜脈與肺動脈樹相吻合，連接中間會出現肺部毛細血管，發育不全可出現一處或多處肺動靜脈瘻。20%可由肝硬化、外傷、手術、二尖瓣狹 窄、放線菌感染、結核病、血吸蟲病、系統性澱粉樣變性等疾病累及造成。妊娠可導致肺部動靜脈畸形加重，診斷依靠CT、超聲心動圖、聲學造影、肺動脈造影等造影是最準確方法，病情嚴重者可考慮經導管栓塞治療，效果比較理想。
肺結節是指胸部X線或CT片上可見小侷限性、類圓形、影像學表現密度增高陰影，可單發或多發，基本上都不伴肺不張、肺門腫大和胸腔積液等表現。孤立性肺結節無典型症狀，常為單個、邊界清楚、密度增高、直徑≤3cm且周圍被包含氣肺組織包繞軟組織影。局部病灶直徑＞3cm者稱為肺腫 塊，肺癌可能性相對較大，常見小結節多指直徑在1cm以下類型，肺多數疾病都會形成結節，良性如炎症、結核、黴菌、亞段肺不張、出血等，診斷是多種多樣，良性包括炎性假瘤、錯構瘤、結核球、真菌感染、硬化性肺細胞瘤等，惡性是原發性肺癌或肺內轉移瘤。大部分炎症導致小結節是可以在治療後吸收，少數在自身免疫系統修復功能下自行吸收。小結節是可以自動消失，也有是結節小，在CT掃描層面沒有切到時表現為消失，實際上它是存在。約90%小結節都是良性病變，一般3-6個月複查一次胸部CT，連續3年以上無明顯變化，可基本排除惡性腫瘤病變可能。
應該叫縱隔腫瘤，不叫肺部縱隔腫瘤，縱隔腫瘤根據部位分很多，根據病變部位、病變大小，大多數都可以手術，但是不能說得了縱隔腫瘤，就一定能手術，要根據具體部位、具體大小、良惡性質，跟周圍的重要組織的結構，比如大血管、肺的關係，來決定他是否能夠手術切除，不能說我得了縱 隔腫瘤，是不是能夠手術，需要專科的專業的大夫來根據胸部的CT，甚至增強CT，來作出具體的判斷，不能夠一概而論。大多數的縱隔腫瘤，尤其是前縱隔腫瘤和後縱隔腫瘤，如果是偏良性腫瘤，如果腫瘤不是特別大，跟周圍的一些重要結構，比如血管、神經、肺或者氣管沒有明顯的侵犯，沒有明顯的粘連，大多數的縱隔腫瘤可以通過手術來治療。