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腸結核與克羅恩病的鑑別，主要從以下幾個方面進行，第一是臨床表現上克羅恩病常有腸外表現，比如說口腔潰瘍，關節的紅腫熱痛等腸結核很少有這種腸外表現，第二個是從病史上，腸結核患者常常有其他部位的結核病史，比如說肺結核，第三個是實驗室檢查，腸結核患
腸結核患者通常不容易診斷，如果是有明確診斷的話，早期通常是採用抗結核治療，如果患者是出現有明顯比較嚴重的併發症時，可以進行手術治療，抗結核的治療應該是選擇足量並且規範的抗結核藥物至少是應用18個月，3到6個月是選擇四聯治療，為強化治療階段，
腸結核在早期最常見的臨床症狀是腹痛，尤其多見於右下腹部疼痛，因為腸結核的合法部位是回盲部為右下腹。經常會出現上腹部疼痛，或者臍周疼痛，這是因為回盲部的病變所引起的牽涉痛，如果在此時做體格檢查可以發現右下腹部是明顯的壓痛點，這種疼痛往往表現為
腸結核更推薦腸鏡，從診斷角度要看潰瘍形態是否符合腸結核，另外更關鍵的是要進行活組織檢查，加強診斷。鋇餐做不到活組織檢查，我們一般稱它叫鋇灌腸，需要從肛門灌鋇劑，並不作為積極推薦，從複查隨診的角度也是推薦腸鏡檢查觀察抗結核治療後黏膜是否癒合。