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隱睪術後睪丸萎縮，隱睪本身可能存在睪丸發育不良，特別年紀稍大兒童手術時，睪丸發育不良情況可能更嚴重。若小時候即出現睪丸發育不良，術後同樣可能出現睪丸發育不良。部分兒童術後陰囊外觀較大，但並非可能為睪丸組織，可能混雜其它組織。但是隨著組織水腫消退後，陰囊即會相應縮小，因睪丸本身萎縮、組織，可通過B超進行觀察。
兒童在寒冷刺激情況下或其它因素情況下，提睪肌可收縮，兒童睪丸分量較輕，可將睪丸收回去，睪丸往上回縮，通常上述情況是一種正常現象。隱睪指睪丸無法下降到正常位置，需通過手術治療。正常兒童睪丸通過提睪肌收縮可回縮到上面，但放鬆情況下，可以迴歸正常。
隱睪手術成功情況與嚴重程度有關。如果隱睪較為嚴重，屬於腹腔型，手術一期或二期即可將睪丸下降至陰囊內，後期睪丸可正常生長，即可認為成功。對於腹股溝型隱睪等較為輕度的情況，需將睪丸下降至陰囊內，更要求手術後實現美觀外觀。
正常、成功的隱睪手術不影響生育，而對生育恢復起幫助作用。如果不正常的手術，可能損傷到精索、輸精管的組織，損傷睪丸，手術後睪丸萎縮可能容易產生。正常手術對生育有幫助，術後睪丸在正常陰囊裡面，正常溫度下面生長，睪丸會正常生長，後期不育可能性減少。若手術未正常操作，可能在處理鞘狀突時損傷到輸精管，導致影響生育。