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腸易激綜合徵腹痛、腹瀉可用鈣離子拮抗劑（匹維溴銨）等解痙藥。腹痛嚴重者，可用質子泵抑制劑止痛。腹瀉可用思密達、培菲康、整腸生、雙歧桿菌等調整腸道菌群的西藥。還可用抗抑鬱焦慮的藥。便秘可用乳果糖類滲透性瀉藥，也可用麻仁潤腸丸等中成藥。還可採用按摩、穴 位貼敷、針灸等治療。
腸易激綜合徵是反覆發作的功能性疾病。如經常喝酒或吃辣的、涼的、油膩的食物，或者情緒很緊張，就容易引起腸易激綜合徵。因為腸易激綜合徵易反覆發作，所以完全治癒很難。如果有飲食或者情緒的影響，腸易激綜合徵就容易反覆發作，所以不容易治癒。
腸易激綜合徵是功能性疾病，腸易激綜合徵有腹痛、腹瀉、便秘症狀，或者腹瀉、便秘交替出現；根據主要症狀分為，腹瀉主導型、便秘主導型、腹瀉便秘交替型。精神、飲食、寒冷等因素可誘使症狀復發或加重。通過腸鏡檢查一般腸裡面是光滑的，沒有任何病變。所以腸易激綜合徵不會癌 變，患者不必要過分擔心。