顱底凹陷症手術後一定要注意不能過伸過屈扭動頸部，因其為頸部和顱交界處的手術，過伸過屈均可能造成再次損傷。而術後睡覺的姿勢一般是仰臥位或側臥位，沒有什麼特殊要求。

顱底凹陷症術後如果有吞嚥、咳嗽反射減弱，多側臥睡，以免誤吸。而對於術前肢體癱瘓的病人，一定要注意被動活動，即陪床者給患者進行肢體的被動運動，以免血栓形成，關節僵硬，因關節僵硬也會影響生活。