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子宮內膜異位症發病率較高，正常女性子宮內膜生長於宮腔內，子宮內膜隨月經剝脫。如果剝脫的子宮內膜生長於子宮腔外其它部位，如生長於卵巢或盆腔內，在女性月經來潮時，子宮內膜異位生長部位也可能發生出血現象，稱為子宮內膜異位 症。
卵巢型子宮內膜異位症佔子宮內膜異位症的80%左右，一般出現囊腫情況較為常見。囊腫大小不同，則對卵巢功能的損傷程度也不同，如果囊腫較小，主要會造成卵巢周圍的粘連，對卵巢的功能、大小，以及卵泡數量影響較小。但如果卵 巢囊腫較大，該側卵巢正常組織可被侵蝕，從而導致卵巢功能下降，此時病情較為嚴重。
內異症的診斷主要是依靠患者臨床症狀，還有婦科檢查以及相關輔助檢查。輔助檢查最主要以彩超為主，對於彩超無法發現的疾病類型，比如深部浸潤型內異症，需要完善相關CT、核磁檢查，有助於幫助診斷，以及瞭解病灶的生長部位、生長的範圍，還有組織學、病理學的結果是 不是完全符合疾病診斷，尤其是做病理診斷，病理診斷是診斷疾病的金標準。部分內異症患者，現在也可以通過腹腔鏡的檢查做明確診斷。因為腹腔鏡檢查是微創手術，微創手術對患者創傷較小，並且微創手術取病理可以明確診斷。並且把內膜異位症的腹腔鏡手術作為一種金標準的診斷方式。患者盆腔、子宮、卵巢佔位的病變都可以用腹腔鏡作為檢查。
子宮內膜異位症的手術治療後如果復發，一般不主張再次進行手術治療。因為手術的本身可能會導致卵巢儲備功能的進一步下降，同時降低術後再次生育的可能性，而且手術本身並不能夠根治子宮內膜 異位症，並非是一勞永逸的方式。所以對於仍然希望懷孕的女性而言，如果卵巢巧克力囊腫在血清標記物的檢查不過高，或者B超下提示惡性的可能性不高時，可考慮在輔助生殖的過程中進行陰道B超的引導下囊腫穿刺術，並且將其送去病理化驗，明確是否有惡性的可能。通常而言子宮內膜異位症，由於手術的本身只能清除肉眼所見的細小病灶，而對於肉眼不能所見的極細小病灶是無法完全徹底的清除，故而當手術後此部分病灶再度生長出來的時候，則會進行不停的復發。對於這樣的患者而言，手術的本身已經無法解決這樣的問題。因此，對於只要不是惡變可能、體積不大的病灶，且沒有明顯症狀表現的情況下，一般主張藥物和觀察為主。但是對於有生育要求的女性，一定積極到生殖專科醫院就診。
子宮內膜異位症做完手術之後還會復發，而且復發的可能性比較大，做手術時醫生可能就會告訴你，子宮內膜異位症是長期慢性的疾病，不是做一次手術就能解決問題。術後會有長期的用藥或者隨訪過程，以後很可能會復發，而且在某一個 特定的時期，它還有可能發生惡變，所以子宮內膜異位症是很令人煩惱的疾病，會有長期的隨訪過程。但是確實有一部分人做完卵巢囊腫，比如巧克力囊腫這一類的子宮內膜異位症，可能過7-8年之後才復發，或者一直就沒有復發。
子宮內膜異位症打3針，是指使用長效的促性腺激素激動劑進行治療。據報道對於子宮內膜異位症，尤其是腹膜型或卵巢型子宮內膜異位症，應用長效的促性腺激素激動劑以後，因為其可起到降調後閉經作用，所以能夠使內膜異位病灶在短期 內減少、縮小。
治療子宮內膜異位症的中藥方，一般認為中醫學的治療原則是以活血化瘀、散結止痛為主，在這個基礎上，還要根據各個患者的具體的情況進行辨證論治。根據患者不同的證候類型，像氣滯血瘀、寒凝血瘀、溼熱瘀結、痰瘀互結、氣虛血瘀、腎虛血瘀等這種證型 ，結合痛經、真假包塊、月經不調、不孕等不同病證進行治療。因為該病發生與月經週期有密切的關係，一般以月經週期出現的繼發性痛經症狀為主，所以治療時必須要結合月經週期的不同時期以及不同體質分別進行論治。經前的子宮內膜異位症中藥調理，一般是以經前調氣祛瘀為主，經期主要是以活血祛瘀還有理氣止痛為主，經後是以扶正去邪為主。針對辨證治療，如果是寒凝血瘀的患者，一般會採取溫經散寒、活血化瘀為主的治療，可以運用當歸四逆湯加減治療，治療寒凝型的子宮內膜異位症，在臨床當中也取得比較好的治療效果，還可以糾正患者的機體內分泌紊亂。氣滯血瘀症是以理氣止痛、活血化瘀為主進行治療，在中醫中採用這種方法可取得比較好的療效。對於腎虛血瘀的患者，中藥的處方是以益氣補腎、化瘀為主進行治療，不同的經驗方治療也非常有效果。
子宮內膜異位症的治療，主要依據病灶位置及病灶大小判斷，臨床上以卵巢部位最常見，如卵巢巧克力囊腫，以手術治療為主，手術治療可達到祛除病灶的目的，另外可明確診斷。因卵巢腫瘤在明確病理前，無法判斷其良性與惡性程度，手術治療可去除病灶指導後續治療，同時祛除卵巢巧 克力囊腫或子宮內膜異位症病灶，如無其他因素導致不孕，術後部分患者可自然提高受孕率。
子宮內膜異位症的症狀較多，最典型的主要是以盆腔疼痛為主，大概70%-80%的患者有不同程度的盆腔疼痛，包括繼發性、進行性痛經，慢性盆腔疼痛、性交痛、還有肛門墜痛，40%-50%的患者可以合併有不孕。子宮內膜異位症的患者有可能會有腰疼和腰部不適的症狀，但是腰疼也不一定就是 子宮內膜異位症，比如泌尿系統疾病。部分患者有結石、腎積水，也可能導致腰疼，有手術病史的患者都可能產生腰疼和不適的症狀，所以要及時就診，到醫院裡詳細檢查，進行彩超明確診斷，進行系統的檢查就可明確診斷。
子宮內膜異位性不孕的症狀表現，即包括子宮內膜異位症表現，又包括不孕症表現，其中不孕症又可理解為子宮內膜異位症中常見症狀。子宮內膜異位症以痛經為主要表現，同時可伴下腹隱痛或不適感，此外可降低育齡期女性懷孕概率，同時也是患者就診生殖中心的常見原因。少 數特殊部位子宮內膜異位症可表現同房後疼痛，或局部觸及異常結節。
子宮內膜異位症是由於子宮內膜生長在子宮內膜以外的部位，子宮內膜異位症的自愈環境，只能說體內的雌激素程度降得非常低，以至於無需時間就會病癒。要是有這種環境，像育齡婦女就不大有自愈的可能，只能漸漸的生長，到更年期以後，大概到了絕經期以 後，當雌激素低到原來的1/5以下時就有自愈的時機。由於隨著時間推移慢慢的女性會到絕經期，卵巢功能逐漸衰退，如果沒有這種環境就沒有自愈的可能。子宮內膜異位症在構造上是良性的，但是臨床舉動以及臨床表現是和惡性腫瘤一樣，出現增生、浸潤、擴散，以及向血管播散和遠處轉移的特徵。只要有卵巢構造排洩激素，這個病就會漸漸加重，該病是雌激素依賴性疾病，現在便被稱為良性的癌。並不是全部子宮內膜異位症患者病情都是連續生長，連續生長的病人只佔到1/3，病情會越生長越重，但也會在某個年齡段又相對穩定下來，大約有2/3的病人病情會停頓在某一程度上，這個穩固是相對的。子宮內膜異位症的患者要實時到專業婦科門診去檢查，以尋求最佳的治療方案，減輕痛苦。子宮內膜異位症的藥物治療應該限定在以緩解痛苦、傷心，延緩復發為目標，同時顧及患者的一個生養要求。因此，子宮內膜異位症的治療，分為單純的藥物治療、術前的藥物治療以及術後的藥物治療為主。