巧克力囊腫手術以後一般需要休息一個月左右，如果身體恢復良好，就可以恢復上班。但是手術以後身體比較虛弱或者有併發症，就應當適當的後延恢復正常作息以及上班的時間。巧克力囊腫手術以後還應當在醫生指導下應用藥物預防復發，比如亮丙瑞林。這種藥物應用以後會影響到內分泌，另外還可能會出現更年期症狀，要注意作息規律，適當補鈣。