首先巧克力囊腫發生破裂，容易造成盆腔內感染，所以在破了以後，要注意使用抗生素進行抗感染治療。其次，囊腫破了以後，囊內的一些液體，包括子宮內膜異位細胞，會種植到盆腔其他的部位，造成多發性的卵巢子宮內膜異位症。還有破裂的液體，容易造成盆腔內部黏連，為以後的手術治療造成障礙。所以如果巧克力囊腫比較大，要及時採取手術治療。