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結核性腦膜炎治療療程比較長，應該有耐心、有信心，在醫師指導下，進行系統、有針對性治療，療程可以長達1年以上。治療以後還是應該提高警惕，因為結核性腦膜炎容易復發，一般情況下治療1-2年，控制好症狀以後，在2-3年之內有可能會復發，觀察5年之後沒有復發，才認為臨床治療效果比較理想。此時CT、核磁等影像學檢查正常、腦脊液檢查正常，一切臨床指標都正常的情況下，5年以內不再復發，可以認為治癒。
結核型腦膜炎治療療程較長，治療時間可能長達幾個月，通常需要9-12個月才能治好。結核桿菌需要進行足量、足療程的治療，因為結核桿菌容易耐藥和抵抗，所以治療難度較大。當懷疑有結核型腦膜炎，比如中樞神經系統感染時，需要及時啟動抗結核的治療。
中樞神經系統結核感染，在腦部可以表現為腦部結核瘤，或者是結核性腦膜炎，對於結核性腦膜炎的臨床症狀，首先是會有全身症狀，比如發熱、乏力、盜汗等消耗症狀，其次在臨床上結核性腦膜炎可以表現為頭疼、噁心、嘔吐，有腦膜刺激徵等症狀。同時因為顱底病變可能會導致多顱神經受損，比如眼球外眨神經、面神經等可能都會受到結核型腦膜炎的影響。
新型隱球菌的腦膜炎抗真菌治療，應首選兩性黴素B聯合5-氟胞嘧啶。兩性黴素B是多烯類的抗真菌藥物，能選擇性的與真菌細胞膜上的麥角固醇結合，使細胞膜的通透性增加，最終導致真菌死亡。兩性黴素B治療中樞神經系統的隱球菌病， 療效肯定，該藥具有抗真菌譜廣、耐藥真菌少、半衰期長及每日只需用藥一次的優點。但該藥不良反應也較突出，包括寒戰、發熱、頭痛、食慾減退、噁心、嘔吐、腎功能損害、貧血和肝損害等。
細菌性腦膜炎是由細菌引起的急性中樞神經系統感染性疾病，本病通常是急性或亞急性疾病，患者多出現頭痛、頸部僵硬感、發熱、意識障礙則少見。各年齡段人群有不同的臨床表現，具體如下：
缺鐵性貧血是臨床上最常見的貧血類型，尤其常見於育齡期的女性，以及生長發育期的少年兒童。對於這些缺鐵性貧血的患者，在日常生活中，要儘量少食用穀類的食物，如小米、大米粥等等，同時儘量避免飲用乳類，包括酸奶、純牛奶等等；避免飲用茶水，這些食物都會與鐵元素結合形成大分子的化合物，影響鐵元素吸收。
腦膜炎奈瑟菌又稱為腦膜炎雙球菌，感染人體可導致流行性腦脊髓膜炎。本病的主要臨床表現是突發高熱、劇烈頭痛、頻繁嘔吐、皮膚黏膜的瘀點、瘀斑以及頸項強直等腦膜刺激徵，嚴重者可出現敗血症休克、腦實質的損害，可以危及生命，部分患者爆發起病可迅速致死。腦膜炎雙球菌主要經咳嗽、打噴嚏及飛沫，由呼吸道直接傳播，因為本菌在外界的抵抗力較弱，或者間接傳播的機會較少，但密切接觸，如同睡、懷抱、接吻、哺乳等會感染，對兩歲以下的嬰幼兒的發病，具有重要意義。