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肛瘻外口閉合可以戳破。如果外口閉合以後重新形成膿腫，可以做外口切開引流，即老百姓所說的戳破或者擠破，膿流出來以後就不太疼了，但是切不切開、戳不戳破對於疾病整體進程沒有幫助。患者一旦形成肛瘻，外口閉合以後有可能再次形成膿腫，肛管感染細菌或者糞便殘渣再進到竇道里，如果沒有缺陷口，可能在皮下再形成感染性病灶，如果不戳破，患者可能特別疼。
如果肛瘻手術後兩個月出現肛門潮溼，還有分泌物，多因為肛瘻手術損傷括約肌導致，屬於手術後正常狀態。肛門括約肌受到損傷以後會形成壕溝樣通道，使肛門閉合不良。這時肛門內肛腺分泌的液體會通過小溝壑逐漸溢出到肛門外， 這些酸性腸液溢到肛門外刺激肛門，甚至引起皮炎、肛門瘙癢的感覺。
痔瘡是人類的常見病之一，和肛瘻類似，都發生在肛門周圍。但痔瘡和肛瘻是兩種疾病，痔瘡是因肛管內血管發生曲張、腫大、出血、脫出導致的一類良性疾病，和肛瘻類感染性疾病來源不同，痔瘡不是感染性疾病。
女性發生肛瘻的原因和男性相同，都是由肛腺感染引起，而肛腺感染通常以肛門後位為主。肛門周圍感染由後位肛腺引起的感染比較多見，也有的瘻形呈馬蹄形，向肛門左側、右側蔓延。但女性因為前方有陰道，所以容易出現一種特殊的瘻管，即感染到肛門前位膿腫，很容 易從直腸前壁間隙感染陰道，甚至從陰道破潰形成肛門陰道瘻。
高位複雜性肛瘻是肛瘻中非常複雜的問題，我國常用手術方法是祖國醫學的切開掛線療法，也就是對於周圍組織中瘻道、膿腔進行徹底開放引流。對肛管內的內口和經過括約肌的部分瘻管實行掛線處理，通過肌肉瘻管進行掛線，可以通過線的緊縮和橡皮筋 緊縮使肌肉逐步壞死，通過1-2周時間，掛線肌肉部分緩慢被切斷。隨著一部分肌肉粘連使肛門括約肌保持一定完整性，是保護肛門括約肌必要的措施，也是目前最好的辦法。
肛周膿腫切開引流以後都會形成肛瘻，肛周膿腫主要是來源於肛腺感染。肛周膿腫是在肛門周圍組織中間形成的感染灶，來源是在肛腺破壞以後感染形成的肛周膿腫。肛周膿腫經皮膚引流，高位膿腫、低位膿腫都可以通過皮膚引流到皮膚外，引流到皮膚外以後，膿腫的來源是從肛管肛腺開始。肛管的肛腺沒有得到正確的處理，所以膿腫硬塊則不會消失，必須將所有的病灶都切除、處理，引流、掛線，從而才能夠使硬塊徹底消除。
如果手術後發生排尿困難，一般主張患者先進行熱水坐浴，把肛門傷口泡在熱水裡面，使括約肌能夠很快鬆弛。如果括約肌鬆弛，排尿問題通常很快可以解決。如果通過服藥、物理處理後都不能排尿，此時則需要導尿。所以導尿還是最後一個環節，應儘量 通過通過熱敷、坐浴、止痛順利把尿排出。
肛瘻手術後患者都比較急切，做了手術都希望儘快恢復。但肛瘻手術以後創面恢復需要經過幾個時期，肛瘻手術後前1-2天存在傷口滲出期，滲出期是傷口內膿液和血性分泌物的排洩過程，長短不一。如果是深部肛瘻，排洩期可以在一週，小的肛瘻1-2天可以排淨。當傷口膿液排淨，傷 口則開始癒合。
肛瘻做完手術以後傷口癒合約需20-30天，傷口癒合後兩個月仍然存在疼痛感，要注意疼痛是否和原來膿腫時疼痛相同。如果還有跳痛，或者肛門周圍存在腫塊，或有分泌物、流膿，可以判斷是否存在肛瘻復發的問題。
肛瘻手術以後最容易出現、也是醫生和病人共同擔心的有以下兩個併發症：1、肛門功能受到損傷即控便功能下降，患者可能有輕度控便功能異常、稀便控制不良甚至完全失禁；2、傷口假性癒合，假性癒合會造成肛瘻復發。為避免肛門功能下降，患者應該在肛瘻術後 早期進行提肛功能鍛鍊。提肛功能鍛鍊即進行縮肛，每天30-50下左右。鍛鍊的過程也比較痛苦，尤其是在有傷口和創面的情況下進行。患者應該克服痛苦、恐懼的心理，因為手術以後肛門功能一旦減低對生活質量的影響非常大，所以必須進行提肛鍛鍊。如果進行損傷比較大的手術或者創面的傷口非常大，提肛鍛鍊的次數要適當增加，比如每天50-100下，分次進行，一次大概7-8下。持續、多次的提肛一般人很難做到，因為肛門肌肉進行鍛鍊時候非常勞累、疲勞，所以一般一次7-8下，一天分幾次進行，湊齊30-50下。此外，為避免肛瘻術後假性癒合，存在以下兩個方法：1、換藥當中徹底清理傷口，對傷口進行特殊處理；2、使兩側臀部分開，使傷口儘量有一定時間避免兩側完全粘合，也能避免假性癒合的發生；3、如果無法做到分開兩側臀部，則建議進行下蹲動作。下蹲時臀部肌肉都會牽扯著肛門口向兩側張開，所以每天下蹲15-30次左右也有利於預防假性癒合的發生。