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腔鏡手術與傳統手術相同，而且具備比傳統手術更好的局部美觀效果。腔鏡手術與甲狀腺傳統的開放手術相同，均可能引起喉返神經損傷，患者可出現聲音嘶啞；還有喉上神經損傷，可表現為飲水嗆咳；亦有可能出現 甲狀旁腺損傷，出現術後手足抽搐、低鈣表現。上述均不屬於腔鏡手術特有的併發症。
甲狀腺疾病的檢測主要包括甲狀腺功能檢測、甲狀腺自身抗體檢測、甲狀腺超聲，甲狀腺功能主要包括總T3、總T4、遊離T3、遊離T4以及促甲狀腺激素，這些激素可以幫助判斷甲狀腺功能。
甲狀腺微波消融術在最近10年發展非常迅速，最早興起於超聲介入科，現在逐漸得到專業的認可，臨床中多會選擇微波消融的治療方法。其優點在於簡便微創、創傷非常小，而且安全有效。通過超聲引導能精準到1mm，很多3-5mm甚至1cm的甲狀腺結節，在開放手術中難以看到，但超聲引導消融針可以精準穿刺到甲狀腺結節，並通過高溫燒燬結節。
甲狀腺微波消融手術的總體危險性不大，如果醫生在術中操作不當，或消毒不徹底、手法不當，探頭跟針不匹配，或穿刺針誤穿到氣管或皮膚其它部位，會造成氣管損傷、皮膚燙傷、神經損傷等。如果是有經驗的醫生進行操作，手術風險則相對較小。