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流行性甲型腦炎屬於病毒性腦炎，目前並沒有針對性特別強的抗病毒藥物。對於病毒性腦炎，更多是給予積極支持和營養治療。如果患者出現腦細胞水腫情況，可以給予脫水降顱壓治療；其次是改善患者的營養狀況，增強抵抗力進行治療。
腦炎是腦實質炎症性疾病的總稱，腦炎是神經科醫生經常面對的疑難危重病症之一。目前腦炎的病因診斷面臨很多困難，臨床上有半數左右的腦炎病例，雖然經過全面檢查仍然不能明確病因，即使在診斷技術條件比較先進的國家和地區也是如此。腦炎的病因包括病毒感染和自 身免疫性腦炎兩大類，以病毒性腦炎更常見。自身免疫性腦炎是一類由自身免疫性機制而介導的腦炎，自身免疫性腦炎如果合併相關腫瘤，就稱為副腫瘤性自身免疫性腦炎，而副腫瘤性自身免疫性腦炎中符合邊緣性腦炎的，稱為副腫瘤性邊緣性腦炎。
腦電波異常放電其實臨床上比較常見的是癲癇，癲癇患者往往提示腦電波異常放電，可以出現特定波形如出現尖波、棘波、棘慢波或尖慢波，如果出現特殊波形，結合患者的臨床表現和發作類型，一般可以診斷癲癇。但不是所有的腦電圖異常放電就提示一定是癲癇，還可以見 於其他疾病。如果是瀰漫性慢波，常見於大腦皮層的瀰漫性病變，缺血缺氧性腦病、中樞神經系統變性病和中樞性疾病的脫髓鞘疾病都可以出現瀰漫性慢波。三相波常見於肝性腦病或其他原因引起的中毒、代謝性腦病，還有一種是週期性三相波，症狀比較特異，可以見於朊蛋白病，是一種慢病毒感染，如克雅氏病、瘋牛病。因此腦電圖的異常放電最常見的是癲癇，但是也可以見於其餘中樞神經系統病變。
腦脊液培養時間不確定，因為隨時都會報陽，也可一直都不報陽，與腦脊液中細菌的數量以及腦脊液的抽取量、細菌種類都有關係。如果細菌含量較多，可能幾小時就報陽，這時就要進行下一步處理。如果一直沒有報陽，如連續培養5天，5天之後如果還沒有報陽，就認為培養是 陰性。
腦炎主要臨床表現為發熱、頭痛、頭暈，部分患者會有噁心、嘔吐症狀。由於顱高壓增高會導致噁心、嘔吐症狀，所以低燒、嘔吐不一定是腦炎，但腦炎患者會有低燒、嘔吐症狀。低燒、嘔吐也可能是其它疾病導致，如胃腸消化道的炎症 也會出現低燒、嘔吐症狀，其它疾病可能也有類似症狀，所以主要根據兒童本身情況，結合其它臨床表現和輔助檢查判斷是否患有腦炎。
散發性腦炎伴發的精神障礙較嚴重，此類患者精神障礙不同於精神病。散發性腦炎首先為發燒，發燒或拉肚子一週後出現散發性腦炎。散發性腦炎的精神症狀可影響患者日常生活，症狀主要為意識模糊，生活尚能自理，但完成較差。症狀稍重患者生 活無法自理，甚至意識改變，出現不同於正常狀態行為等情況，重度腦炎可危及生命，具有一定死亡率。