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肛周膿腫手術費用，與術式有關，若進行單純切開引流術、線形切口排膿引流，費用在1000-2000元左右。若進行肛周膿腫切開縫合術，費用約3000元。若進行肛周膿腫掛線術、一次性切開根治術，費用需3000-8000元。
肛周膿腫手術後2-3天后要進行切口敷料更換，最好到正規的肛腸科外科門診就診。需要把肛門內汙染的紗布或引流條取出，通過局部的碘伏和雙氧水徹底消毒之後，可以局部加用康復新液或去腐生肌膏等藥物，填塞新的無菌紗布，預防局部的感染。換藥後也需要靜脈輸入抗生素治療，治療3-5天后如果疼痛或腫脹明顯消失，可以適當的停藥。
肛周膿腫破了以後，患者一定要及時手術，因為肛周膿腫破了並不代表肛周膿腫已經癒合，只是說明肛周膿腫的病情進一步發展，在局部形成了肛瘻，而肛瘻一般比肛周膿腫更為嚴重，所以患者一定要及時進行手術，避免肛周膿腫形成肛瘻，導致不能癒合。
肛周膿腫屬於細菌感染導致，目前比較有效的外抹藥物是百多邦、匹得邦、美多信等藥物，屬於抗生素類藥物，用法是一天塗抹三次，塗抹前後注意局部清潔，三天症狀可以明顯緩解，五天作為一個療程，觀察症狀緩解情況。
肛周膿腫是細菌感染引起的化膿性炎症，早期應該以應用抗生素治療，口服或者輸注抗生素。比較嚴重時可以通過手術切開引流之後，膿液引流乾淨後可以應用去腐生肌膏以及消炎軟膏等。
部分肛周膿腫患者可能需要二次手術，大部分患者膿腫感染可能不是特別嚴重，相對比較簡單都可以一次性解決。但是對於膿腫範圍較大、感染較深的患者，可能需要進行分次手術，需要二次或者三次手術。